齿轮的建模是一项较为烦锁的过程，除了要对齿轮各参数有比较深的认识，熟练掌握通过参数的调整来达到精密建模的目标，还得很熟练地运用自己操作的三维软件，知悉其特点，功能。如果基本模型不精确，在装配时要想达到比较理想的要求也就无从谈起了。
精确的模型，在装配时才能看到符合要求的装配。楼主所提，实际上也就是基本模型不精确，有时仅是个示意图，齿数肯定是对的，螺旋角也斜向了给定的方向，用来作为教学，告诉学生，让学生有个很简单的印象，这就叫斜齿轮，够用了，但要在大模数，且齿侧间隙仅有0.04时，精确地表现齿面都是不干涉的，应该是都共轭的，互相符合严格的运动关系，用通用软件就比较困难了，所以在使用免费的一些软件时，会对装配得不到正确的结论产生疑问，甚至会觉得模型是正确的，运动关系不可靠这样的后果，那里错呢，我认为还是基本的模型是错的，才会有装配后是错的这样的结果。
精密建模，是现代化工艺改革中，用精密法点切削得到模型实体的基本要求，也对机械设计人员提出了更高的要求，而这，是用免费软件所不能支撑的。
要想得到精确的模型，就得再自己从头开始研究，找到通用软件在设计模型时的误差，通过基本的建模，自己做出精确的模型。
建模中，一是螺旋角，要突破大螺旋角建模误差极大的困难，二就是大齿宽，齿宽逐渐加大后，会带来模型的精度明显下降，这样也就说明基本模型本身的精度就是有问题的，只不过比较小，尚看不出来。三是齿数，涉及到过度曲线的精确，当齿数较少时，再用普通圆弧就不太管用了，齿根会有明显的干涉，在极少齿数时，例如渐开线蜗杆，只有一，二，三，四齿，如果按普通的斜齿轮去建模，困难就很大。
这些都是需要设计人在设计的过程中提高自己的基本素质的。
有心者，事竟成。
在UG软件中，利用二次开发功能对传动副的精密建模及装配过程：（全齿宽300mm）
不断调整中心距或者旋转某齿轮后得到的微接触：（微接触厚度低于0.005mm）
在啮合运动中啮合的迹线始终一致在齿面上滑动，说明在整个齿面上，曲面都符合共轭规律。
论坛有高人
建模是不是没有那么精确